杨毅嫉恶如仇，发誓杀死一百个恶人之后归隐山林。步入江湖十余年，他已经杀死了九十六个恶人，这里边有杀人不眨眼的大盗，虐杀公婆的恶妇，欺凌弱小的恶霸……每一次杀死恶人后，他都会在恶人身上留下一枚竹牌，上面写着“恶人第××号”几个隶书小字。日照一带的坏人提起杨毅，就汗毛竖起，冷汗直冒，浑身打哆嗦。
一个夏日，杨毅远赴黑龙江与同道切磋武功，一个月后，尽兴而归。杨毅的住处在日照城西文山上的一座山神庙里，当他路过一片槐树林准备回住处时，忽然听见附近传来一阵哭泣声。杨毅循声望去，却看见一个中年妇人将一根绳子抛在一个树杈上，将脖子搭上去就要上吊。杨毅忙甩出一支袖箭，将绳子一斩两断。
杨毅上前扶起妇人，说：“大嫂有什么想不开的，非要走这条路？”妇人看着杨毅，泪如雨下，哭诉道：“你还是让我死吧，我活不下去了！”
原来，妇人叫牛李氏，是日照县牛家村人，膝下没有儿女，与丈夫牛三相依为命。牛三是个樵夫，身体很结实，整天上山打柴，然后带到日照县城卖掉换一些日用品，这日子虽然不富裕，但是温饱还是有保证的。
这天，牛三偶感风寒，浑身酸痛，牛李氏就赶忙去日照县城有名的济世堂药铺给丈夫抓药。济世堂的大夫叫王世普，他粗粗问了牛李氏几句牛三的病情，就开了一个药方，让伙计照单抓药。
回家后，牛李氏把药煎了，然后端给丈夫喝。牛三喝了之后就感到头昏脑涨，便上床睡了。可是万万没有想到，第二天，牛李氏就发现丈夫面色铁青地死在了床上。
杨毅插言道：“这么说，是那个庸医的药夺去了你丈夫的命？”牛李氏擦了擦眼泪，说：“我也觉得是这样，因为我丈夫的身体一向是很结实的，于是我就去济世堂讨说法。那个王世普却死不承认，最后竟然……竟然……”牛李氏再也控制不住自己的感情，号啕大哭起来。
杨毅急问：“后来怎么了？他对你做什么了？”牛李氏止住哭，说：“这个王世普有钱，又与县太爷有关系，后来他竟然去县衙把我告了，说我诬陷好人，影响他的形象，对他的生意造成了很大的影响，要我向他道歉并且赔偿损失五十两银子。这是恶人先告状，我自然不服，就在公堂上与他争执起来。那个县太爷竟然说我咆哮公堂，将我乱棍打出。”
说到这儿，牛李氏顾不上羞耻，一把掀起衣服，让杨毅看她身上的斑斑伤痕。杨毅气得大喊一声：“岂有此理！这天下还有王法吗！”
这天，王世普要去乡下出诊，当走到城郊一个偏僻之所时，忽然一人从一棵大树上跳了下来，用一把短刀逼住了王世普。王世普忙说：“好汉，此时白家村正有一个重病号等着我去诊治，性命攸关的事，还请好汉行个方便。只要你放过我，我把身上的钱财全部给你，如不够，可以到我济世堂去拿，我决不食言。”来人正是杨毅，他冷笑道：“庸医，你以为我会相信你的鬼话吗？你去救人？说你去害人才对！”说完，杨毅不由他分说，手起刀落，顿时鲜血四溅，可怜王世普顿成刀下之鬼。
做完这一切，杨毅又将一块上书“恶人第九十七号”的竹牌留在了王世普身上。做完这一切，他回到住处，呼呼大睡。
第二天下午，杨毅忽然听见外边人声鼎沸，像是很多人正朝这边走来。
杨毅一惊，提着刀走出山神庙，眼前的情景却令他惊呆了。原来，外边站着几十个手持叉子、铁锨还有镐头的百姓，他们正怒视着杨毅。杨毅忙问：“乡亲们，你们这是要干什么？”一个白须老者问：“杨大侠，济世堂的王世普大夫是你杀的吗？”杨毅点了点头，说：“那姓王的坏事做尽，死有余辜！”老者顿足道：“你好糊涂呀！”
原来，这王世普并不像牛李氏说的那样是个草菅人命、仗势欺人的庸医。恰恰相反，王世普是一个医术高超、医德高尚的人，而且收费低廉。有的贫苦百姓得病后手头没钱，王世普就把医药费给免了，晚上急病号需要他出诊，即便是冰冻三尺的寒冬，即便是百里之外，王世普也会即刻起床前去诊治。所以，王世普在百姓中很有威信，大家也都愿意找他看病。
却说日照县内还有一个药铺，叫润生堂，是日照县最早的药铺，店主叫刘士甄。他医术也很不错，但是医德不行，去他药店看病，少一个铜板他也不会让你离开，而且晚上从不出诊，即便是患者生命垂危。
济世堂开业之后，眼见着患者都跑到那里去了，刘士甄不从自身找原因，却怨恨起王世普来，屡次找他的茬，都以失败告终。好在王世普大人大量，从不与他计较。
后来，刘士甄无意间知道了杨毅到了兖州府，又心生毒计，派自己的老婆李氏，在杨毅必经的路口，装作要上吊的样子，被杨毅救下之后，又说出一番被庸医王世普逼得无路可走的话来。果然，嫉恶如仇的杨毅上当了，杀死了王世普。
老者说：“杨大侠，这一次王医生原是给一个大出血的产妇出诊的，却被你给耽误了。大人死了，一个男人从此失去了他的爱妻，一个小孩从此没有了母亲，你想想，这一次你的罪孽有多大？”
杨毅听了后悔莫及。他对老者和众人说：“你们容我一晚，明天我定给大家一个答复。”当晚，润生堂店主刘士甄两口子被人杀死，留下的竹牌分别是恶人第九十八号和恶人第九十九号。他们的身边还躺着另外一个人，正是日照义侠杨毅，他是自杀而死的，他的身上也有一块竹牌，上写：恶人第一百号。
